Lavdosh Jaupaj travail à l’Institut d’archéologie de Tirana, qui centralise et coordonne toutes les recherches, fouilles et études, sur le territoire de l’Albanie. Dirigé par Luan Përzhita, il comprend quatre sections : le Département de préhistoire, le Département des Antiquités (urbanisation de l’Illyrie et de l’Épire du Nord, Ve-Ier siècle av. J.-C) ; le département des antiquités romaines, et le Département de l’Antiquité tardive et le Moyen Âge. La 2e section, concernée par le projet, traite des principaux problèmes liés à la mise en place et au développement des villes illyriennes, à la fois les villes proto-urbaines illyriennes et les colonies grecques sur la côte illyrienne. Elle étudie par le biais de fouilles, menées parfois dans le cadre de missions internationales, l’organisation politique de ces cités et leur urbanisme dans les différents stades de développement, sans oublier les activités économiques de la production et des échanges et les relations culturelles entre Grecs et Illyriens. Les villes étudiées dans le cadre du projet sont celles d’Amantia, Antigoneia, Apollonia, Bouthrotos, Byllis, Dimale, Epidamne-Dyrrachium, Lisi, ou Orikos. L’Institut d’archéologie de Tirana est également le protagoniste de la valorisation du patrimoine archéologique à la destination du grand public.